研究者たちは現在、エンドカンナビノイド系が多くの生理的・病理的プロセスにおいて重要な役割を果たしていると考えている。とりわけ、食欲、睡眠覚醒リズム、痛み、ストレス認知に関与し、細胞間コミュニケーションや細胞死にも関係している。神経系への影響を通じて、恐怖、愛情、喜び、落ち着きのなさといった感情にも関与している可能性がある。
ECSの主要な構成要素はカンナビノイド受容体である。今のところ、2つのタイプが知られている：
- CB1受容体である。主に脳（海馬、小脳）に局在し、腸にも存在する。
- CB2受容体。主に免疫系や骨代謝の骨芽細胞と破骨細胞に存在する。
専門家たちは、さらなるECS受容体の存在を考えている。
そのような受容体は、非常に特異的な分子とのドッキング部位である。カンナビノイドがそれぞれの鍵であるドアロックのようなものだと想像することができる。そのような分子の鍵が受容体の錠にはまると、シグナルが送られ、最終的に体内で特定の作用が引き起こされる。これまでのところ、ECSは以下のような状態やプロセスに関与していることがわかっている：
- 食欲
- 消化
- 免疫機能
- ストレス
- 炎症
- 睡眠覚醒リズム
- 生殖・生殖能力
- 痛み
- 記憶
- 気分
- 不安／パニック発作
研究者たちは、多発性硬化症やパーキンソン病などの自己免疫疾患においても、エンドカンナビノイド系が新たな治療の道を開く可能性を示唆している。カンナビジオール（CBD）などの植物性カンナビノイドがその役割を果たすかもしれない。CB1受容体は、ある種の活性化の後、うつ病に対抗できることがすでに発見されている。同様に、否定的な記憶の消去にもCB1受容体が関与していることが示唆されている。このように、ECSは不安障害と闘う上で重要な役割を果たす可能性がある。